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姓    名:
刘长宁
性    别:
职    务:
 
职    称:
研究员(自然科学)
通讯地址:
云南省勐腊县勐仑镇西双版纳热带植物园
邮政编码:
666303
电子邮件:
liuchangning@xtbg.ac.cn
 中文简历:
 

  

1.个人情况 

姓名 刘长宁;性别 男;出生年月 197812 

籍贯 湖南长沙;婚姻及家庭状况 已婚; 

有效联系方式 151-9873-0541 liuchangning@xtbg.ac.cn 

    

2.学习经历: 

1996.9 - 2000.7 武汉大学 国家生物学基地班 学士 (导师 黄诗笺教授)  

2002.9 - 2007.7 中科院计算技术研究所 生物信息学 博士 (导师 李国杰院士、陈润生院士)  

2006.6 - 2007.1 哈佛大学Dana Farber癌症研究所 访问学生 

3.工作经历: 

2007.7 - 2010.7 中科院计算技术研究所 助理研究员  

2010.7 - 2014.9 中科院计算技术研究所 副研究员  

2011.1 - 2013.1 德克萨斯大学达拉斯分校 访问学者  

2014.9 至今  中科院西双版纳热带植物园 研究员 

 

 

 
 英文简历:
 
 研究领域:
      

1. 基于高通量测序数据分析和分子生物学实验的植物功能基因组 (Functional genomics) 研究; 

2. 基于宏基因组分析的微生物生态学 (Microbial ecology) 研究; 

3. 基于进化分析和多种模式生物基因网络的长非编码RNA (Long non-coding RNA) 功能研究。 

 社会任职:
 
 获奖及荣誉:
 
 代表论著:
 

01) Liu, C., B. Bai, et al. "Noncode: An Integrated Knowledge Database of Non-Coding Rnas." Nucleic Acids Res 33, no. Database issue (2005): D112-5. (影响因子 9.2 引用次数 200) 

02) Zhang, Z.#, C. Liu#, G. Skogerbo, et al. "Dynamic Changes in Subgraph Preference Profiles of Crucial Transcription Factors." PLoS Comput Biol 2, no. 5 (2006): e47.  (影响因子 4.6  计算生物学类 Top3) 

03) He, S.#, C. Liu#, G. Skogerbo, et al. "Noncode V2.0: Decoding the Non-Coding." Nucleic Acids Res 36, no. Database issue (2008): D170-2. (影响因子 9.2 引用次数 108) 

04) Zhao, Y.#, S. He#, C. Liu#, S. Ru, et al. "Microrna Regulation of Messenger-Like Noncoding Rnas: A Network of Mutual Microrna Control." Trends Genet 24, no. 7 (2008): 323-7. (影响因子 9.9 引用次数 33) 

05) He, S.#, H. Su#, C. Liu#, G. Skogerbo, et al. "Microrna-Encoding Long Non-Coding Rnas." BMC Genomics 9,  (2008): 236. (影响因子 3.9 引用次数 51) 

06) Yuan, X.#, C. Liu#, P. Yang, et al. "Clustered Micrornas' Coordination in Regulating Protein-Protein Interaction Network." BMC Syst Biol 3,  (2009): 65. (影响因子 2.2 引用次数 86) 

07) Liu, C.*, J. Li and Y. Zhao. "Exploring Hierarchical and Overlapping Modular Structure in the Yeast Protein Interaction Network." BMC Genomics 11 Suppl 4,  (2010): S17. (影响因子 3.9 第九届国际生物信息学大会,大会报告) 

08) Liao, Q.#, C. Liu#, X. Yuan, et al. "Large-Scale Prediction of Long Non-Coding Rna Functions in a Coding-Non-Coding Gene Co-Expression Network." Nucleic Acids Res 39, no. 9 (2011): 3864-78. (影响因子 9.2 引用次数 194) 

09) Liao, Q., H. Xiao, ..., Z. Wu, C. Liu* and Y. Zhao*. "Ncfans: A Web Server for Functional Annotation of Long Non-Coding Rnas." Nucleic Acids Res 39, no. Web Server issue (2011): W118-24. (影响因子 9.2引用次数 69) 

10) Li, J., Z. Xuan and C. Liu*. "Long Non-Coding Rnas and Complex Human Diseases." Int J Mol Sci 14, no. 9 (2013): 18790-808. (影响因子 3.3 invited review 引用次数 42) 

 承担科研项目情况:
 
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